93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0554 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  373  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  96.85 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  50.29 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  45.74 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  46.28 
 
 		 197 aa  167  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  49.11 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  48.55 
 
 		 223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  45.83 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  42.47 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  40.32 
 
 		 206 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  42.63 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  40.41 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  47.9 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  47.9 
 
 		 163 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  42.63 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  40.59 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  45.5 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  42.71 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  41.57 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  39.05 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  42.19 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  42.08 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  47.02 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  42.46 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  37.95 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  40.45 
 
 		 203 aa  137  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  37.75 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  45.18 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  40.12 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  39.52 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  34.23 
 
 		 251 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  35.03 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  36.46 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  38.12 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  121  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  38.67 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  33.81 
 
 		 221 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  32.52 
 
 		 239 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  48.28 
 
 		 107 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  29.26 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  47.19 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.59 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  28.67 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  26.99 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  23.24 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  28.86 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.48 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  26.06 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  27.08 
 
 		 149 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.93 
 
 		 1345 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.93 
 
 		 1372 aa  51.6  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  23.24 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.06 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  25.56 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  23.6 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  24.38 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  24.81 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  24.65 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.15 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  32.22 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  23.64 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  29.03 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  23.29 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  26.11 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  26.21 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25.97 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  28.72 
 
 		 212 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  23.65 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  24.24 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25.44 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  26.56 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  25.68 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  25.68 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  25.68 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  22.93 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  25.68 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  21.95 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  24 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  22.09 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  24.32 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  21.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  22.6 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>