77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0818 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  43.23 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  40.99 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  38.36 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  44.1 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  39.87 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  39.87 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  39.87 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  40.14 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  48.51 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  34.97 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  37.8 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  36.57 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  39.22 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  36.13 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  31.9 
 
 		 169 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  38.82 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  36.6 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  32.68 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  31.52 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  35.63 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  34.97 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  32.43 
 
 		 283 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  29.49 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.41 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  30.34 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  31.13 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  26.22 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  37.35 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  32.9 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  37.35 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  28.03 
 
 		 243 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  36.14 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  28.93 
 
 		 371 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  26.75 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  30.32 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  30.6 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  27.03 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  28.68 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  26.54 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  24.61 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  26.76 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.76 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  26.76 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  25.77 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  29.93 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  23.7 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  35.48 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  25.73 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  25.73 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25.95 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  27.06 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  26.49 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  32.73 
 
 		 575 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05910  hypothetical protein  25.15 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  25.3 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  25.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  28.1 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  25.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  36.51 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  34.92 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.61 
 
 		 513 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  25.58 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  33.82 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  33.82 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  33.82 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  33.82 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  26.06 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>