More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0069 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1817  transketolase  68.94 
 
 
632 aa  879    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  68.87 
 
 
636 aa  944    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  69.1 
 
 
634 aa  895    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  68.62 
 
 
632 aa  874    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  77.99 
 
 
636 aa  1040    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  62.62 
 
 
639 aa  810    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  68.62 
 
 
632 aa  877    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  100 
 
 
636 aa  1304    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  75.79 
 
 
633 aa  999    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  67.76 
 
 
656 aa  901    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  45.74 
 
 
654 aa  549  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  45.99 
 
 
662 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  46.12 
 
 
666 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  45.96 
 
 
666 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  45.96 
 
 
666 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  45.96 
 
 
666 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  46.12 
 
 
666 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  45.01 
 
 
666 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  45.01 
 
 
666 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.81 
 
 
680 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  45.81 
 
 
666 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  45.55 
 
 
697 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  45.65 
 
 
666 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  45.05 
 
 
667 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  44.85 
 
 
666 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  44.68 
 
 
653 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  45.19 
 
 
666 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  45.5 
 
 
680 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  44.78 
 
 
671 aa  535  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.55 
 
 
666 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  46.26 
 
 
665 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  44.26 
 
 
664 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  43.53 
 
 
668 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  44.51 
 
 
668 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  45.81 
 
 
666 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  45.02 
 
 
668 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  45.03 
 
 
676 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  45.03 
 
 
676 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  43.66 
 
 
684 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  42.55 
 
 
668 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  44.48 
 
 
666 aa  521  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  45.23 
 
 
667 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  45.07 
 
 
682 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  45.23 
 
 
667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  45.23 
 
 
667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  45.23 
 
 
667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  45.23 
 
 
667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  45.23 
 
 
667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  45.23 
 
 
667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  46.83 
 
 
668 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  44.57 
 
 
672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  45.08 
 
 
667 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  43.55 
 
 
711 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  42.22 
 
 
699 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  44.24 
 
 
661 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  44.24 
 
 
660 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  44.11 
 
 
666 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  45.41 
 
 
698 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  43.75 
 
 
674 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  42.84 
 
 
691 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  44.56 
 
 
660 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  42.84 
 
 
691 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  43.96 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  42.23 
 
 
664 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  43.96 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  43.96 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  43.96 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  42.25 
 
 
671 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  43.6 
 
 
688 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  44.81 
 
 
684 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  43.95 
 
 
665 aa  504  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  42.6 
 
 
675 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  43.69 
 
 
665 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  43.97 
 
 
666 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  42.3 
 
 
666 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  44.07 
 
 
679 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  42.62 
 
 
671 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  43.8 
 
 
665 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  44.01 
 
 
667 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  43.1 
 
 
711 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  43.59 
 
 
663 aa  505  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  43.95 
 
 
665 aa  505  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  42.36 
 
 
664 aa  502  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  43.19 
 
 
655 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  42.07 
 
 
657 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  43.68 
 
 
660 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  41.86 
 
 
671 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  43.52 
 
 
665 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  43.7 
 
 
663 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  43.81 
 
 
662 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  42.51 
 
 
692 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  42.73 
 
 
695 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  43.43 
 
 
668 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  42.03 
 
 
712 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  44.43 
 
 
668 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  45.12 
 
 
686 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  43.98 
 
 
678 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  43.55 
 
 
664 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  43.18 
 
 
660 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  42.39 
 
 
694 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>