More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2016 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 225 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  34.29 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.88 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  39.44 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.25 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  33.5 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>