155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4598 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1377  cyclic nucleotide-binding protein  82.06 
 
 		 411 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.826586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 414 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3788  cyclic nucleotide-binding protein  67 
 
 		 416 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32626  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4631  cyclic nucleotide-binding protein  66.75 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0942105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3733  cyclic nucleotide-binding protein  66.75 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0188297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2360  cyclic nucleotide-binding protein  66.25 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5468  cyclic nucleotide-binding protein  64.34 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3615  cyclic nucleotide-binding protein  64.59 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5000  cyclic nucleotide-binding protein  65.24 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  35.85 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.43 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.06 
 
 		 226 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.79 
 
 		 228 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.43 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.61 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.43 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.2 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.97 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.82 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.97 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.6 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.51 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.97 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  36.51 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.33 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  35.65 
 
 		 157 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31 
 
 		 129 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.51 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.52 
 
 		 225 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 215 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 503 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 227 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.89 
 
 		 225 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 		 563 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.15 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  31.09 
 
 		 747 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 233 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.91 
 
 		 224 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  29.06 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.17 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.63 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 		 119 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5645  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.84 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 221 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.5 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4231  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 225 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  35.85 
 
 		 1040 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  26.12 
 
 		 157 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  30.97 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  40.54 
 
 		 948 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.51 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  31.45 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  31.07 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  29.75 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  28.38 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  36.92 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.38 
 
 		 224 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.18 
 
 		 736 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.92 
 
 		 224 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.2 
 
 		 225 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 		 236 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 237 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  29.59 
 
 		 227 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.78 
 
 		 224 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  31.37 
 
 		 158 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  37.18 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.21 
 
 		 1018 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  35.64 
 
 		 1018 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>