93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3615 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3733  cyclic nucleotide-binding protein  90.59 
 
 		 416 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0188297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3615  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 412 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3788  cyclic nucleotide-binding protein  89.67 
 
 		 416 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32626  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4631  cyclic nucleotide-binding protein  90.59 
 
 		 416 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0942105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2360  cyclic nucleotide-binding protein  90.08 
 
 		 414 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5000  cyclic nucleotide-binding protein  80.15 
 
 		 413 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5468  cyclic nucleotide-binding protein  98.79 
 
 		 427 aa  821    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1377  cyclic nucleotide-binding protein  65.22 
 
 		 411 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.826586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  64.52 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.15 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.84 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.15 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.2 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.51 
 
 		 225 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 215 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 		 253 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 171 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 226 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.47 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  33 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.51 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  29.73 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.23 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  33.91 
 
 		 157 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  27.05 
 
 		 225 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 224 aa  50.4  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.91 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 644 aa  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  30.15 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  30.15 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  42.47 
 
 		 948 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  30.15 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.27 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.14 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 		 227 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.33 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.61 
 
 		 225 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  26.5 
 
 		 157 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  39.02 
 
 		 123 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 		 1056 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 156 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.3 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  39.77 
 
 		 736 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.48 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.69 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4606  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.96 
 
 		 503 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  30.91 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  28.32 
 
 		 747 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  27 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 226 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.23 
 
 		 220 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 228 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  30.36 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 228 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  26.56 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3749  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 		 127 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 		 237 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 247 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  36.84 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.45 
 
 		 232 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 		 243 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  28.23 
 
 		 228 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4082  cyclic nucleotide-binding  19.47 
 
 		 220 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  27.55 
 
 		 227 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  26.42 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>