More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2291 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  94.15 
 
 		 205 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  77.45 
 
 		 206 aa  322  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 206 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 206 aa  259  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  62.07 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  32.45 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  42.97 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  58.21 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  37.25 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  53.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>