More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3084 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  42.56 
 
 
266 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  43.98 
 
 
267 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  40.32 
 
 
243 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
248 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  41.48 
 
 
231 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.82 
 
 
228 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 
220 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 
220 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  36.96 
 
 
220 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  38.5 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.09 
 
 
220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 
220 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 
221 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.68 
 
 
221 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 
221 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 
220 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.14 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.14 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.58 
 
 
607 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.22 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.75 
 
 
219 aa  92  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.96 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.91 
 
 
609 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.07 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.64 
 
 
319 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 
210 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.33 
 
 
330 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.57 
 
 
294 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  44.86 
 
 
222 aa  85.9  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.87 
 
 
402 aa  85.5  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.9 
 
 
542 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 
440 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  29.27 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.91 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
544 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
206 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  28.88 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  42.31 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 
729 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.82 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  30.08 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.69 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  30.08 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  45.98 
 
 
631 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  40.91 
 
 
214 aa  79  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  43 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  43 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  43 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  29.67 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  43 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  43 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  43 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  29.67 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  29.67 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  43 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  41 
 
 
277 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
374 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.43 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  44.04 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.72 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  39.81 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  40.91 
 
 
620 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>