More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1087 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1087  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 795 aa  1643    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.13 
 
 		 667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  32.18 
 
 		 693 aa  301  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.56 
 
 		 712 aa  299  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  29.83 
 
 		 751 aa  293  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 770 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.81 
 
 		 806 aa  290  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 		 732 aa  290  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 		 662 aa  289  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 713 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 713 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 713 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 		 643 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 713 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 713 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 713 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.98 
 
 		 730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.14 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.98 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 661 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 643 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 643 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 		 905 aa  280  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 710 aa  280  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  33.28 
 
 		 642 aa  280  8e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.74 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 654 aa  278  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.82 
 
 		 775 aa  278  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.13 
 
 		 648 aa  276  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  31.17 
 
 		 707 aa  276  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  31.47 
 
 		 655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  30.88 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.64 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  29.78 
 
 		 734 aa  275  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.33 
 
 		 638 aa  273  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.77 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.45 
 
 		 625 aa  272  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.59 
 
 		 761 aa  272  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.29 
 
 		 720 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  32.05 
 
 		 687 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  31.55 
 
 		 744 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  32.9 
 
 		 735 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  30.56 
 
 		 704 aa  271  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.27 
 
 		 648 aa  271  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.52 
 
 		 811 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.53 
 
 		 723 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  31.75 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  32.06 
 
 		 705 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  29.82 
 
 		 757 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  30.97 
 
 		 780 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.92 
 
 		 739 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 654 aa  270  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.11 
 
 		 679 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.66 
 
 		 712 aa  269  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  33.4 
 
 		 714 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 		 730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  33.57 
 
 		 709 aa  267  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  28.42 
 
 		 720 aa  267  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0177  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 886 aa  267  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 750 aa  267  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 641 aa  266  8e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 755 aa  266  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  31.62 
 
 		 760 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.93 
 
 		 827 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 714 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.7 
 
 		 640 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  30.7 
 
 		 705 aa  266  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  31.94 
 
 		 827 aa  266  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 714 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 795 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  30.86 
 
 		 701 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.87 
 
 		 642 aa  264  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.27 
 
 		 741 aa  264  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  31.31 
 
 		 778 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 649 aa  263  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 714 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  30.98 
 
 		 651 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  30.7 
 
 		 880 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.58 
 
 		 727 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  30.98 
 
 		 750 aa  261  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  30.31 
 
 		 791 aa  261  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 		 774 aa  261  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 762 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.68 
 
 		 676 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.64 
 
 		 779 aa  260  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  33.16 
 
 		 774 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  31.58 
 
 		 881 aa  259  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  33.16 
 
 		 774 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  33 
 
 		 791 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  32.77 
 
 		 757 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  32.56 
 
 		 774 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31.54 
 
 		 626 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 669 aa  258  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  30.19 
 
 		 759 aa  258  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.53 
 
 		 761 aa  258  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>