More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0177 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0177  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
886 aa  1834    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.96 
 
 
796 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  30.64 
 
 
803 aa  327  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  31.34 
 
 
794 aa  327  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.41 
 
 
817 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  30.44 
 
 
817 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  30.44 
 
 
817 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.69 
 
 
643 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  31.3 
 
 
794 aa  319  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  31.79 
 
 
778 aa  317  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  31.86 
 
 
830 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  30.75 
 
 
771 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  33.28 
 
 
890 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  31.98 
 
 
778 aa  314  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  30.2 
 
 
817 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.1 
 
 
791 aa  313  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  32.73 
 
 
792 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 
646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  30.91 
 
 
800 aa  310  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.33 
 
 
643 aa  310  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.33 
 
 
643 aa  310  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  32.17 
 
 
795 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  32.97 
 
 
757 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  32.45 
 
 
797 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  32.17 
 
 
797 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  31.82 
 
 
794 aa  309  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  29.64 
 
 
823 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  32.66 
 
 
797 aa  308  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 
751 aa  308  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  31.84 
 
 
797 aa  307  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  29.73 
 
 
823 aa  307  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  31.72 
 
 
779 aa  306  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 
799 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  31.66 
 
 
748 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.71 
 
 
806 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  32.08 
 
 
778 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  31.67 
 
 
804 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
763 aa  304  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
730 aa  304  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.99 
 
 
640 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  31.34 
 
 
797 aa  303  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  29.92 
 
 
818 aa  302  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.48 
 
 
770 aa  302  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  29.96 
 
 
791 aa  301  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  31.74 
 
 
833 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 
766 aa  300  9e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.41 
 
 
739 aa  300  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  30.07 
 
 
819 aa  299  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  29.33 
 
 
815 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.08 
 
 
640 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  31.76 
 
 
799 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  31.65 
 
 
836 aa  299  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  30.56 
 
 
824 aa  297  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.17 
 
 
720 aa  297  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 
786 aa  296  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  30.96 
 
 
805 aa  295  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.08 
 
 
642 aa  295  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  29.34 
 
 
814 aa  293  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.34 
 
 
618 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.69 
 
 
734 aa  293  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 
709 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  33.61 
 
 
709 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 
709 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.46 
 
 
735 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.05 
 
 
642 aa  291  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.94 
 
 
649 aa  291  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2122  glycosyl transferase family 51  29.08 
 
 
829 aa  290  7e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.329284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.77 
 
 
766 aa  290  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  32.32 
 
 
707 aa  290  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.19 
 
 
833 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  28.57 
 
 
841 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  30.37 
 
 
799 aa  289  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 
656 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.79 
 
 
654 aa  288  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  32.64 
 
 
705 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.5 
 
 
679 aa  288  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.18 
 
 
732 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  32.38 
 
 
714 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.85 
 
 
728 aa  287  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  33.43 
 
 
801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 
791 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.71 
 
 
727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.31 
 
 
795 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
793 aa  284  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  30.69 
 
 
773 aa  284  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.6 
 
 
727 aa  283  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.89 
 
 
734 aa  282  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.5 
 
 
641 aa  281  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 
777 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.57 
 
 
799 aa  281  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.31 
 
 
648 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  30.86 
 
 
797 aa  281  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 
777 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  29.22 
 
 
793 aa  281  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  30.63 
 
 
802 aa  281  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.46 
 
 
880 aa  280  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  30.29 
 
 
750 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  31.53 
 
 
625 aa  280  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  32.52 
 
 
713 aa  280  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  32.52 
 
 
713 aa  280  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>