More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  58.33 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  56.59 
 
 
210 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  55.71 
 
 
281 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  58.67 
 
 
224 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  54.5 
 
 
215 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  48.78 
 
 
234 aa  199  5e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  53.85 
 
 
686 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  53.59 
 
 
705 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  51.83 
 
 
703 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  50.45 
 
 
671 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  52.4 
 
 
221 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  51.44 
 
 
206 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  50.23 
 
 
688 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  51.24 
 
 
901 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  52.94 
 
 
707 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.57 
 
 
205 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  50.24 
 
 
686 aa  178  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.65 
 
 
688 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  50.75 
 
 
232 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  52.94 
 
 
662 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.19 
 
 
207 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  50 
 
 
226 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.16 
 
 
204 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.75 
 
 
202 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  50 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.7 
 
 
221 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  44.95 
 
 
206 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  45.54 
 
 
234 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  41.87 
 
 
197 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.15 
 
 
206 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  44.19 
 
 
213 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.95 
 
 
209 aa  158  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.25 
 
 
207 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.63 
 
 
206 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.41 
 
 
215 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.9 
 
 
216 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  43.14 
 
 
206 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  43.14 
 
 
206 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  43.14 
 
 
206 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  42.65 
 
 
206 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  42.65 
 
 
206 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.08 
 
 
225 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.75 
 
 
218 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  49.76 
 
 
219 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.13 
 
 
214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  46.46 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  44.92 
 
 
206 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.51 
 
 
199 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  42.65 
 
 
206 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.07 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.6 
 
 
236 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  42.86 
 
 
211 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  44.93 
 
 
244 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.4 
 
 
213 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.83 
 
 
203 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  41.2 
 
 
234 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  43.75 
 
 
207 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.85 
 
 
210 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  43.94 
 
 
217 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  44.92 
 
 
206 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.13 
 
 
200 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  41.23 
 
 
226 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  38.46 
 
 
206 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.67 
 
 
213 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  44.1 
 
 
203 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  46 
 
 
244 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.46 
 
 
215 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  39.81 
 
 
210 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.43 
 
 
207 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  40.09 
 
 
213 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  43.94 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.91 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.72 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  41.67 
 
 
221 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.29 
 
 
211 aa  144  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.15 
 
 
217 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  39.58 
 
 
205 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  42.66 
 
 
230 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  39.58 
 
 
205 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.44 
 
 
214 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  47.98 
 
 
707 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  44 
 
 
236 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.06 
 
 
217 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  40.39 
 
 
213 aa  142  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.72 
 
 
210 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  42.74 
 
 
730 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.23 
 
 
222 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  39.91 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  43.54 
 
 
210 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.45 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  42 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>