More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7466 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  52.3 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.81 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  39.86 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  38.85 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.82 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 303 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.1 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  32.53 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  29.66 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  30.96 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>