230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5294 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  47.19 
 
 
238 aa  145  4e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
238 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
238 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  47.19 
 
 
238 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  47.19 
 
 
238 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
238 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
187 aa  82.8  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
205 aa  82  5e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
177 aa  77.4  1e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
188 aa  77.4  1e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
209 aa  73.9  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
207 aa  73.2  2e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
217 aa  72.8  3e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
217 aa  72.8  3e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
205 aa  72  4e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
205 aa  72  4e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  32.93 
 
 
208 aa  72  5e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  32.54 
 
 
198 aa  70.5  1e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
210 aa  70.5  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 
205 aa  70.5  1e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 
207 aa  70.5  1e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
205 aa  70.1  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
231 aa  68.9  4e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
188 aa  68.9  4e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
186 aa  68.6  5e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
214 aa  66.6  2e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
194 aa  65.5  5e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
192 aa  64.7  7e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
187 aa  63.9  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
185 aa  63.5  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 
182 aa  62.4  4e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
209 aa  61.6  7e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
188 aa  61.6  7e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
197 aa  61.2  8e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
180 aa  61.2  9e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
224 aa  60.5  1e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
182 aa  60.1  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
206 aa  60.1  2e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
184 aa  59.7  3e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.1 
 
 
189 aa  58.5  5e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
202 aa  58.5  6e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  58.2  7e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
207 aa  58.2  7e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
207 aa  58.2  7e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
202 aa  57.8  9e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
199 aa  57.4  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
187 aa  57  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
186 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
199 aa  55.5  5e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  42.11 
 
 
202 aa  54.7  8e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 
184 aa  54.7  9e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  42.25 
 
 
203 aa  53.5  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
214 aa  53.1  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  37.14 
 
 
219 aa  53.1  2e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
219 aa  53.1  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
187 aa  52.8  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
215 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 
177 aa  52  5e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 
209 aa  50.8  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
453 aa  50.8  1e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 
195 aa  50.1  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
193 aa  50.1  2e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 
209 aa  49.3  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  28.23 
 
 
215 aa  48.9  4e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
188 aa  48.5  5e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
192 aa  48.5  5e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  28.57 
 
 
190 aa  48.5  5e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  23.01 
 
 
200 aa  48.1  6e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.7358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
211 aa  48.5  6e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
200 aa  48.1  8e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47212e-06 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.26521e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
196 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.36887e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
247 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  34.69 
 
 
210 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>