204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6245 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 1117 aa  2063    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  60.15 
 
 		 2141 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  58.52 
 
 		 1854 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  57.64 
 
 		 1546 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  57.64 
 
 		 1471 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  57.64 
 
 		 1471 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  58.38 
 
 		 1434 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  57.95 
 
 		 1353 aa  493  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  70 
 
 		 330 aa  344  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  65.1 
 
 		 1487 aa  332  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  35.37 
 
 		 1447 aa  297  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  35.06 
 
 		 1447 aa  296  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.06 
 
 		 1342 aa  296  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  36.1 
 
 		 1446 aa  295  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.76 
 
 		 1472 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  35.81 
 
 		 1616 aa  279  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  35.02 
 
 		 1674 aa  277  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  34.5 
 
 		 1616 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1616 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  35.5 
 
 		 1588 aa  274  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.06 
 
 		 1549 aa  269  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  35.38 
 
 		 877 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  36.3 
 
 		 880 aa  250  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  36.25 
 
 		 876 aa  248  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 820 aa  239  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 816 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 816 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 816 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 816 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 831 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  38.22 
 
 		 831 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.09 
 
 		 831 aa  231  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  35.68 
 
 		 716 aa  225  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  34.79 
 
 		 878 aa  224  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.52 
 
 		 716 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  35.72 
 
 		 4726 aa  212  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.49 
 
 		 1122 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.49 
 
 		 1122 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.85 
 
 		 810 aa  206  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  30.73 
 
 		 2868 aa  204  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  43.79 
 
 		 898 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  38.17 
 
 		 753 aa  196  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  30.67 
 
 		 1074 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.91 
 
 		 1190 aa  185  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  32.79 
 
 		 1440 aa  183  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  33.85 
 
 		 827 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  37.41 
 
 		 1390 aa  178  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  36.73 
 
 		 2504 aa  174  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40.22 
 
 		 1713 aa  173  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  41.05 
 
 		 1012 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.83 
 
 		 2866 aa  173  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  38.36 
 
 		 575 aa  173  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  38.21 
 
 		 2396 aa  172  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  35.4 
 
 		 1654 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  32.68 
 
 		 1411 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  42.41 
 
 		 2505 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  33.64 
 
 		 597 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.47 
 
 		 536 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  43.37 
 
 		 1068 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  42.24 
 
 		 962 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  31.97 
 
 		 1333 aa  161  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  42.29 
 
 		 1186 aa  161  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  42.41 
 
 		 1197 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  42.41 
 
 		 1197 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  33.9 
 
 		 1417 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  42.41 
 
 		 1197 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  33.67 
 
 		 3635 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  45.3 
 
 		 597 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  45.3 
 
 		 597 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  52.73 
 
 		 1451 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  40.68 
 
 		 1204 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  33.66 
 
 		 691 aa  156  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  39.9 
 
 		 589 aa  153  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.87 
 
 		 617 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  36.21 
 
 		 655 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  39.92 
 
 		 1125 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  40.43 
 
 		 2814 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  35.46 
 
 		 2095 aa  144  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  29.05 
 
 		 2832 aa  144  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  36.73 
 
 		 600 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  36.7 
 
 		 2728 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  37.65 
 
 		 1230 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  36.7 
 
 		 2778 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  33.97 
 
 		 737 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  50 
 
 		 2493 aa  138  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  30 
 
 		 2392 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  41.25 
 
 		 492 aa  136  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  32.27 
 
 		 1122 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  32.27 
 
 		 1090 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  32.27 
 
 		 1090 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  32.27 
 
 		 1090 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  34.27 
 
 		 3126 aa  131  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  46.96 
 
 		 472 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  25.68 
 
 		 1516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  45 
 
 		 572 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  32 
 
 		 4384 aa  128  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  28.97 
 
 		 1265 aa  128  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  37.5 
 
 		 601 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  40.94 
 
 		 595 aa  127  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  38.38 
 
 		 2157 aa  126  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>