More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2630 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  446  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  95.73 
 
 
234 aa  444  1e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  100 
 
 
218 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  100 
 
 
218 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  100 
 
 
218 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  80.62 
 
 
224 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  79.49 
 
 
223 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  79.91 
 
 
223 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  80.35 
 
 
223 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  80.35 
 
 
224 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  80.18 
 
 
223 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  79.74 
 
 
223 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  81.08 
 
 
221 aa  363  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.64638e-06  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  79.82 
 
 
221 aa  360  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  80.89 
 
 
223 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  51.89 
 
 
215 aa  212  4e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  52.71 
 
 
215 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  52.2 
 
 
222 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  66.67 
 
 
228 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  71.09 
 
 
226 aa  201  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  61.07 
 
 
169 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  55.63 
 
 
215 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  56.29 
 
 
214 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  45.03 
 
 
211 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  42.79 
 
 
242 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
194 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  52.45 
 
 
183 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  52 
 
 
220 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  54.03 
 
 
201 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  53.78 
 
 
170 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  51.18 
 
 
192 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  51.64 
 
 
202 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  51.18 
 
 
192 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  55.83 
 
 
225 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  50.79 
 
 
404 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  52.94 
 
 
418 aa  153  3e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  52.42 
 
 
382 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  46.3 
 
 
407 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  49.59 
 
 
187 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
407 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
407 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
407 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
407 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
407 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
404 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  45.06 
 
 
404 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  43.83 
 
 
363 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  43.83 
 
 
363 aa  146  2e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  8.11276e-08 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  43.83 
 
 
363 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  50 
 
 
248 aa  145  4e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  51.26 
 
 
369 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  50 
 
 
249 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  51.26 
 
 
212 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  52.1 
 
 
226 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  50 
 
 
258 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  43.21 
 
 
354 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  41.98 
 
 
364 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  42.59 
 
 
353 aa  141  1e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  50.79 
 
 
177 aa  139  4e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  41.77 
 
 
209 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  48.82 
 
 
181 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  50.79 
 
 
177 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  43.87 
 
 
209 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  45.71 
 
 
181 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  50 
 
 
177 aa  136  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
177 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  53.12 
 
 
174 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  49.21 
 
 
177 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.31 
 
 
198 aa  134  1e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  46.85 
 
 
173 aa  134  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.96 
 
 
225 aa  134  1e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  43.66 
 
 
179 aa  134  2e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  47.66 
 
 
177 aa  133  2e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  49.59 
 
 
177 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  1.44437e-08 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  49.59 
 
 
197 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  47.2 
 
 
226 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  46.67 
 
 
166 aa  130  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.48 
 
 
205 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
208 aa  129  5e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
365 aa  127  1e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  41.5 
 
 
207 aa  128  1e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  47.15 
 
 
178 aa  128  1e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  51.67 
 
 
365 aa  127  1e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  5.21128e-05  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  40.45 
 
 
269 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
160 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.26 
 
 
208 aa  125  4e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
160 aa  125  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  36.5 
 
 
221 aa  125  4e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
278 aa  125  4e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.49372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
208 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  40.2 
 
 
207 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  44.93 
 
 
275 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  47.24 
 
 
234 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  47.01 
 
 
170 aa  125  8e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  44.93 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  44.93 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  44.93 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>