255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2199 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
492 aa  1006    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  66.11 
 
 
489 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  69.87 
 
 
469 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  66.53 
 
 
493 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  66.11 
 
 
489 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  41.51 
 
 
706 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  34.51 
 
 
744 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  33.26 
 
 
707 aa  240  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  33.64 
 
 
698 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  32.98 
 
 
715 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  32.32 
 
 
732 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  32.53 
 
 
696 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  34.3 
 
 
706 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.79 
 
 
464 aa  156  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  28.18 
 
 
385 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.98 
 
 
451 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  36.07 
 
 
453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 
488 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  28.54 
 
 
531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  28.67 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  28.47 
 
 
453 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.88 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.91 
 
 
466 aa  106  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  27.49 
 
 
466 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 
652 aa  104  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.29 
 
 
470 aa  103  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  28.43 
 
 
444 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.51 
 
 
443 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  28.47 
 
 
531 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.54 
 
 
654 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.93 
 
 
633 aa  97.1  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.21 
 
 
462 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  29.74 
 
 
451 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.7 
 
 
479 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.49 
 
 
499 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.32 
 
 
647 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.91 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  25.18 
 
 
563 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  24.18 
 
 
574 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  28.87 
 
 
451 aa  84  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  27.74 
 
 
650 aa  84  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  26.17 
 
 
590 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  26.19 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  24.83 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  25.44 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.69 
 
 
592 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  25.52 
 
 
491 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  24.33 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  24.33 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  24.33 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.94 
 
 
951 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.77 
 
 
593 aa  77  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  25.49 
 
 
565 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  24.64 
 
 
593 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  24.84 
 
 
626 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.04 
 
 
517 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
590 aa  73.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  24.43 
 
 
595 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  24.87 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  24.15 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.99 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  25.74 
 
 
558 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  23.5 
 
 
582 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.03 
 
 
548 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 
549 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  22.06 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  25.16 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  24.88 
 
 
658 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.71 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  25.19 
 
 
557 aa  68.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  24.43 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  25.86 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 
601 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.06 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  26.76 
 
 
581 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  25.37 
 
 
548 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.29 
 
 
629 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  22.33 
 
 
622 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  23.46 
 
 
577 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  23.6 
 
 
1632 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  25.38 
 
 
555 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 
594 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  23.04 
 
 
628 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  26.46 
 
 
559 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  21.92 
 
 
1063 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  22.93 
 
 
843 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 
666 aa  64.3  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.13 
 
 
555 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  25.06 
 
 
551 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  25.06 
 
 
542 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  37.66 
 
 
949 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25.65 
 
 
949 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>