More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0031 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  465  1e-130  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  80.7 
 
 
234 aa  359  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
251 aa  183  2e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 
249 aa  181  8e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  45.18 
 
 
249 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  46.93 
 
 
273 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
274 aa  173  2e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
249 aa  172  4e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
254 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
249 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
249 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  44.69 
 
 
270 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  42.24 
 
 
253 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  45.45 
 
 
252 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  43.81 
 
 
272 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
268 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
268 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  41.81 
 
 
249 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
272 aa  164  1e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  41.81 
 
 
249 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  41.81 
 
 
249 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
253 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  41.81 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  41.81 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 
247 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 
244 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  42.41 
 
 
251 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
273 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  42.86 
 
 
251 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  40.09 
 
 
237 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  40.53 
 
 
237 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  42.08 
 
 
232 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  42.06 
 
 
236 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.99 
 
 
255 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.94 
 
 
253 aa  147  2e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  40.43 
 
 
262 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
247 aa  141  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  37.28 
 
 
247 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  41.48 
 
 
248 aa  138  9e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
245 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  40.44 
 
 
242 aa  136  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
247 aa  135  7e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  37.34 
 
 
260 aa  135  7e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  42.92 
 
 
244 aa  134  1e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
234 aa  132  4e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  40.72 
 
 
243 aa  132  4e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  40.28 
 
 
246 aa  129  4e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  35.4 
 
 
246 aa  127  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  41.07 
 
 
233 aa  127  1e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  40.97 
 
 
233 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
255 aa  126  4e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
259 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  8.56086e-05  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
237 aa  124  8e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 
249 aa  124  8e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  35.14 
 
 
248 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  36.21 
 
 
250 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
252 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
240 aa  120  2e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.33 
 
 
238 aa  117  2e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  37.72 
 
 
236 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  34.39 
 
 
254 aa  115  4e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  36.53 
 
 
250 aa  115  4e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  34.39 
 
 
254 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  34.22 
 
 
284 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  35.37 
 
 
242 aa  112  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  36.89 
 
 
236 aa  112  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  37.13 
 
 
299 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  35.37 
 
 
242 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  33.33 
 
 
229 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  35.81 
 
 
234 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
251 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  35.65 
 
 
250 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.02 
 
 
241 aa  109  4e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 
264 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
239 aa  108  7e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  35 
 
 
239 aa  108  7e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
234 aa  108  8e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  36.09 
 
 
253 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  36.09 
 
 
238 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 
266 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 
218 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 
238 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
246 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
246 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  32.02 
 
 
252 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 
215 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
274 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
258 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 
229 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>