More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4095 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
525 aa  1003    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  45.64 
 
 
514 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 
551 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  35.88 
 
 
524 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.2 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 
582 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 
564 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0065  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  31.87 
 
 
399 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  28.62 
 
 
384 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  31.41 
 
 
398 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 
538 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 
363 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 
376 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 
428 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 
354 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  28.07 
 
 
386 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 
368 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  31.68 
 
 
402 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  27.47 
 
 
418 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 
354 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 
410 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 
359 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  29.25 
 
 
253 aa  100  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 
427 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.38 
 
 
385 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  26.94 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  26.89 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 
451 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  27.94 
 
 
382 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  24.73 
 
 
424 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 
460 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 
354 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
466 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
358 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 
354 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 
400 aa  97.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 
354 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
358 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.55 
 
 
379 aa  95.9  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  32.21 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  27.79 
 
 
390 aa  95.9  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  25.51 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  33.68 
 
 
504 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  27.37 
 
 
384 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  29.16 
 
 
440 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  29.56 
 
 
371 aa  94.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  28.41 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  28.41 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  31 
 
 
527 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.18 
 
 
569 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 
451 aa  91.3  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 
357 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 
359 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  28.14 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  25.8 
 
 
354 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  27.66 
 
 
354 aa  90.5  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 
416 aa  90.5  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 
575 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 
537 aa  90.5  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 
581 aa  90.5  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 
406 aa  90.1  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 
406 aa  90.1  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  30.98 
 
 
401 aa  90.1  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 
537 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 
421 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  30.53 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.07 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.68 
 
 
575 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  29.18 
 
 
502 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  28.79 
 
 
415 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  32.06 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  31.68 
 
 
538 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  31.44 
 
 
503 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 
568 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  35 
 
 
546 aa  87.8  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 
404 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  29.73 
 
 
484 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.53 
 
 
352 aa  87.4  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 
583 aa  87  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 
526 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  30.65 
 
 
537 aa  87  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  28.62 
 
 
405 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 
362 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  29.87 
 
 
404 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.6 
 
 
517 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>