More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0024 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0024  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 
200 aa  399  1e-110  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  35.67 
 
 
407 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  37.93 
 
 
653 aa  79.3  3e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  42.05 
 
 
623 aa  79.7  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  33.33 
 
 
639 aa  79  4e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  33.64 
 
 
625 aa  79.3  4e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.93 
 
 
703 aa  79  4e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  41.98 
 
 
617 aa  77.4  1e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1259  DNA primase  40 
 
 
720 aa  77  1e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.88 
 
 
584 aa  77.8  1e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1125  DNA primase  40 
 
 
716 aa  77.8  1e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  30.16 
 
 
539 aa  77.4  1e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  37.62 
 
 
606 aa  77.8  1e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.93 
 
 
674 aa  77  2e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  39.13 
 
 
588 aa  76.6  3e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  52.31 
 
 
559 aa  75.1  6e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  35.48 
 
 
594 aa  75.1  7e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.02 
 
 
578 aa  74.7  8e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  38.2 
 
 
625 aa  74.7  9e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  44.78 
 
 
605 aa  73.9  1e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  34.65 
 
 
552 aa  73.9  1e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.46 
 
 
583 aa  74.3  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  34.48 
 
 
690 aa  74.3  1e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.46 
 
 
582 aa  74.3  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  32 
 
 
576 aa  73.9  1e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.51 
 
 
588 aa  74.3  1e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  30.25 
 
 
578 aa  73.9  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  30.25 
 
 
577 aa  73.6  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.1 
 
 
598 aa  73.2  2e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  33.87 
 
 
578 aa  72.8  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  35.16 
 
 
640 aa  72.8  3e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  33.33 
 
 
560 aa  72.4  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  32.26 
 
 
603 aa  72.8  4e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  35.4 
 
 
577 aa  72.4  5e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  41.3 
 
 
655 aa  72  5e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  40 
 
 
600 aa  72  5e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  36.46 
 
 
653 aa  71.6  6e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.63 
 
 
614 aa  71.6  6e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0641  DNA primase  35.35 
 
 
572 aa  71.6  6e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.82 
 
 
601 aa  71.6  7e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  38.71 
 
 
576 aa  71.2  8e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.95 
 
 
686 aa  71.2  9e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  38.38 
 
 
621 aa  71.2  1e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.4 
 
 
626 aa  70.9  1e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  36.78 
 
 
565 aa  71.2  1e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  34.95 
 
 
682 aa  70.9  1e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  34.94 
 
 
554 aa  70.9  1e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  35.4 
 
 
705 aa  70.9  1e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1407  DNA primase  33.94 
 
 
674 aa  71.2  1e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  36.78 
 
 
565 aa  71.2  1e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.43e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.88 
 
 
587 aa  70.9  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
604 aa  70.9  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  39.18 
 
 
684 aa  70.9  1e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.71 
 
 
595 aa  70.5  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.75 
 
 
587 aa  70.9  1e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  40.3 
 
 
618 aa  69.7  2e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.84 
 
 
611 aa  69.7  2e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  44.93 
 
 
583 aa  70.5  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.91 
 
 
599 aa  69.7  2e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  30.93 
 
 
550 aa  69.7  2e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  34.55 
 
 
653 aa  70.5  2e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.71 
 
 
595 aa  70.1  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.48 
 
 
544 aa  70.1  2e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.06361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  32.26 
 
 
660 aa  70.1  2e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  36.78 
 
 
631 aa  70.1  2e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  32.18 
 
 
579 aa  69.7  2e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.2 
 
 
593 aa  70.5  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  27.33 
 
 
601 aa  70.5  2e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  37.36 
 
 
623 aa  70.5  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  29.29 
 
 
530 aa  69.3  3e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  33.64 
 
 
658 aa  69.7  3e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.5 
 
 
601 aa  69.3  3e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  31.76 
 
 
662 aa  69.3  3e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.23 
 
 
660 aa  69.7  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.15 
 
 
660 aa  69.3  3e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  29.92 
 
 
677 aa  69.3  3e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  39.51 
 
 
673 aa  69.7  3e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.23 
 
 
676 aa  69.3  4e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  34.72 
 
 
612 aa  68.9  4e-11  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  29.52 
 
 
595 aa  69.3  4e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  50 
 
 
694 aa  69.3  4e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  37.63 
 
 
627 aa  68.9  4e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  47.76 
 
 
588 aa  69.3  4e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  47.83 
 
 
567 aa  68.9  5e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  28 
 
 
659 aa  68.9  5e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  52.17 
 
 
679 aa  68.9  5e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.05 
 
 
656 aa  68.9  5e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4250  DNA primase catalytic core  31.58 
 
 
666 aa  68.9  5e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  30.65 
 
 
603 aa  68.9  5e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  44.44 
 
 
663 aa  68.6  5e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  38.55 
 
 
580 aa  68.6  6e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  34.74 
 
 
546 aa  68.6  6e-11  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  30.65 
 
 
603 aa  68.6  6e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  32.93 
 
 
535 aa  68.6  6e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  34.29 
 
 
666 aa  68.6  7e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  50 
 
 
664 aa  68.6  7e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.68 
 
 
651 aa  68.2  7e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  50 
 
 
663 aa  68.6  7e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  32.82 
 
 
636 aa  68.2  8e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.93 
 
 
592 aa  68.2  8e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>