More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4475 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  100 
 
 		 576 aa  1167    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  41.67 
 
 		 1017 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.1 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.13 
 
 		 567 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  31.9 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  31.63 
 
 		 546 aa  266  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.28 
 
 		 552 aa  264  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.44 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  31.8 
 
 		 530 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.1 
 
 		 548 aa  256  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  32.55 
 
 		 538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  33.1 
 
 		 584 aa  253  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.96 
 
 		 550 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.22 
 
 		 553 aa  249  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  33.21 
 
 		 533 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  33.04 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  32.32 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.82 
 
 		 573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  36.78 
 
 		 513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  31.89 
 
 		 552 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.39 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.45 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  32.45 
 
 		 527 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.7 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  34.05 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.09 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  30.71 
 
 		 530 aa  237  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  31.26 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  30.82 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  32.24 
 
 		 559 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  34.04 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  31.5 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.09 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.94 
 
 		 594 aa  226  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  33.75 
 
 		 513 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  31.9 
 
 		 559 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.97 
 
 		 573 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  32.6 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  29.41 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.14 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  29.45 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  27.61 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.45 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  32.26 
 
 		 532 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  33.63 
 
 		 503 aa  219  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  35.57 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  27.26 
 
 		 546 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  29.34 
 
 		 576 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  32.57 
 
 		 551 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  32.08 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  30.55 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.77 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.25 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  31.46 
 
 		 550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  30.49 
 
 		 584 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.77 
 
 		 510 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  31.93 
 
 		 566 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  29.5 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  31.73 
 
 		 551 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.87 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  30.8 
 
 		 561 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  31.47 
 
 		 514 aa  210  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  32.82 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  33.68 
 
 		 519 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  32.25 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  32.09 
 
 		 508 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  32.57 
 
 		 532 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  36.45 
 
 		 570 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  31.34 
 
 		 542 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1105  ATP-dependent DNA ligase  31.26 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  30.78 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  33.39 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  30.73 
 
 		 558 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 584 aa  203  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  29.5 
 
 		 584 aa  203  7e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1145  ATP-dependent DNA ligase  31.09 
 
 		 552 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.646236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  34.76 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  31.97 
 
 		 568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  31.09 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  30 
 
 		 549 aa  200  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  28.98 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  30.15 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.92 
 
 		 522 aa  197  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 583 aa  196  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  34.57 
 
 		 648 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.46 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  32.51 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  34.32 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  30.11 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  29.17 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  32.55 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  35.54 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  34.3 
 
 		 520 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  34.3 
 
 		 520 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  34.3 
 
 		 520 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  35.73 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  30.84 
 
 		 539 aa  193  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  34.69 
 
 		 541 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  30.69 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  30.3 
 
 		 578 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>