More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3227 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  446  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.02 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  46.19 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  47.72 
 
 		 214 aa  187  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.47 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.24 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.83 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.65 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.96 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.35 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.5 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.72 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  43.13 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.26 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  43.63 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  43.88 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  37.67 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  44.16 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.26 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  44.28 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 200 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  37.21 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.63 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  40.95 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  42.57 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  42.51 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  36.32 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  43.16 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  39.62 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  38.86 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  38.32 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  40.38 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 688 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 901 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  39.34 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  43 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  37.74 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  38.6 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40.95 
 
 		 203 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  40.38 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  39.44 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 209 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>