141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2388 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  100 
 
 		 1162 aa  2402    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1176 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1123 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1162 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.81 
 
 		 1203 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1123 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.89 
 
 		 1194 aa  244  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 1232 aa  239  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1153 aa  228  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1196 aa  220  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1069 aa  206  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1065 aa  202  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1125 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1075 aa  198  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1141 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1149 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  23.97 
 
 		 1195 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 1124 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1161 aa  175  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 1167 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 		 1041 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1206 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1173 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  32.32 
 
 		 1298 aa  145  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  22.97 
 
 		 1210 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.84 
 
 		 710 aa  142  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1075 aa  140  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 1105 aa  139  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1132 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1114 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.62 
 
 		 511 aa  132  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1194 aa  129  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1188 aa  127  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  28.71 
 
 		 986 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1257 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1067 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1071 aa  111  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 1105 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1120 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1122 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1068 aa  99.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1126 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1122 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1066 aa  95.1  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1109 aa  94.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1052 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1053 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  28.53 
 
 		 979 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1054 aa  88.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.99 
 
 		 1081 aa  85.9  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25.74 
 
 		 1056 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1074 aa  81.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1008 aa  80.9  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1007 aa  81.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1074 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.89 
 
 		 1068 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1097 aa  78.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1066 aa  78.2  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1008 aa  78.2  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 		 972 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.3 
 
 		 1010 aa  77.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1077 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.16 
 
 		 1125 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 1026 aa  72.8  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1071 aa  72.4  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1105 aa  72  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.62 
 
 		 1066 aa  71.2  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.67 
 
 		 992 aa  68.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.57 
 
 		 1116 aa  67.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 991 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.3 
 
 		 1008 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  29.32 
 
 		 1012 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 1100 aa  65.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1016 aa  64.7  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 993 aa  64.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 871 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1010 aa  62.4  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 833 aa  62  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 935 aa  61.6  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 897 aa  61.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.98 
 
 		 1037 aa  60.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  27.59 
 
 		 1041 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  22.43 
 
 		 994 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1007 aa  59.3  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.47 
 
 		 1001 aa  58.9  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1008 aa  58.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 1066 aa  56.2  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.37 
 
 		 997 aa  55.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 866 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 753 aa  54.7  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.2 
 
 		 1061 aa  54.3  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.35 
 
 		 1030 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 800 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.87 
 
 		 966 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>