More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0484 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
370 aa  748    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  68.65 
 
 
369 aa  504  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 
387 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 
376 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  26.65 
 
 
376 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  26.39 
 
 
376 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.66 
 
 
374 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  26.39 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.37 
 
 
378 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  26.91 
 
 
376 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 
376 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 
376 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.8 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  24.54 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.45 
 
 
370 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
377 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 
390 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  28.07 
 
 
382 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  28 
 
 
366 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  28 
 
 
366 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 
374 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  30.06 
 
 
381 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  24.41 
 
 
376 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.06 
 
 
381 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.06 
 
 
381 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.03 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.49 
 
 
381 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 
393 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 
393 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  30.28 
 
 
378 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.94 
 
 
375 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.05 
 
 
367 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.02 
 
 
367 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.41 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  27.11 
 
 
376 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.82 
 
 
365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.45 
 
 
378 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 
375 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.46 
 
 
375 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.37 
 
 
374 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.19 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.45 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.51 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 
378 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.92 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 
389 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.58 
 
 
366 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.01 
 
 
374 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.75 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  25.59 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  24.18 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  25.73 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  23.82 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.4 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.35 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.15 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  24.66 
 
 
366 aa  133  5e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.87 
 
 
369 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 
372 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.21 
 
 
369 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.23 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  23.02 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.58 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.84 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.02 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  26.3 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.45 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.07 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.64 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 
365 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 
365 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  24.79 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.71 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  26.09 
 
 
362 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 
377 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  28.14 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.1 
 
 
372 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  27.65 
 
 
366 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.02 
 
 
385 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.18 
 
 
370 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 
372 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.69 
 
 
370 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  25.14 
 
 
367 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  27.76 
 
 
372 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.89 
 
 
381 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>