149 genes were found for organism Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pnap_4611  CDS  NC_008760  206  1255  +  1050  hypothetical protein  YP_973775  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4612  CDS  NC_008760  1252  1425  +  174  hypothetical protein  YP_973776  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4613  CDS  NC_008760  1595  2566  -  972  LysR family transcriptional regulator  YP_973777  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4614  CDS  NC_008760  2676  4043  +  1368  D-serine dehydratase  YP_973778  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4615  CDS  NC_008760  4080  5042  +  963  hypothetical protein  YP_973779  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4616    NC_008760  5105  6207  +  1103      normal  0.521418  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4617  CDS  NC_008760  6239  7759  +  1521  amidase  YP_973780  normal  0.130864  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4618  CDS  NC_008760  8170  8457  -  288  hypothetical protein  YP_973781  normal  0.323197  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4619  CDS  NC_008760  8668  8961  -  294  hypothetical protein  YP_973782  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4620  CDS  NC_008760  8966  9190  -  225  hypothetical protein  YP_973783  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4621  CDS  NC_008760  9497  10084  -  588  hypothetical protein  YP_973784  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4622  CDS  NC_008760  10265  10789  -  525  MarR family transcriptional regulator  YP_973785  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4623  CDS  NC_008760  11157  12359  -  1203  oxidoreductase domain-containing protein  YP_973786  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4624  CDS  NC_008760  12359  13327  -  969  ferredoxin  YP_973787  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4625  CDS  NC_008760  13367  14350  -  984  hypothetical protein  YP_973788  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4626  CDS  NC_008760  14401  15390  -  990  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  YP_973789  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4627  CDS  NC_008760  15393  16646  -  1254  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_973790  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4628  CDS  NC_008760  16736  17203  -  468  hemerythrin-like metal-binding protein  YP_973791  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4629  CDS  NC_008760  17550  17975  +  426  hypothetical protein  YP_973792  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4630  CDS  NC_008760  18006  18986  -  981  transposase, IS4 family protein  YP_973793  normal  0.310529  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4631    NC_008760  19374  19694  +  321      normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4632  CDS  NC_008760  19862  20719  +  858  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  YP_973794  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4633  CDS  NC_008760  20814  21116  +  303  hypothetical protein  YP_973795  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4634  CDS  NC_008760  21119  21520  +  402  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_973796  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4635    NC_008760  22839  25060  +  2222      normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4637  CDS  NC_008760  25476  27233  -  1758  hypothetical protein  YP_973797  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4638  CDS  NC_008760  27252  27452  -  201  transposase IS66  YP_973798  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4639    NC_008760  27455  27712  +  258      normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4640  CDS  NC_008760  27967  30036  +  2070  recombinase  YP_973799  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4641  CDS  NC_008760  30049  31482  -  1434  transposase IS66  YP_973800  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4642  CDS  NC_008760  32075  33031  +  957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_973801  normal  0.882664  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4643  CDS  NC_008760  33025  33267  +  243  hypothetical protein  YP_973802  normal  0.777081  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4644  CDS  NC_008760  33334  34617  -  1284  stress protein  YP_973803  normal  0.125989  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4645  CDS  NC_008760  35121  35540  -  420  hypothetical protein  YP_973804  normal  0.60619  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4646  CDS  NC_008760  35589  35774  -  186  hypothetical protein  YP_973805  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4647  CDS  NC_008760  35810  37090  +  1281  transposase, IS4 family protein  YP_973806  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4648  CDS  NC_008760  37056  37760  -  705  transposase, IS4 family protein  YP_973807  normal  0.818744  normal  0.900302  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4649  CDS  NC_008760  37863  38474  -  612  IS1477 transposase  YP_973808  normal  0.220345  normal  0.764176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4650  CDS  NC_008760  38507  38773  -  267  transposase IS3/IS911 family protein  YP_973809  normal  0.204613  normal  0.663628  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4651  CDS  NC_008760  38842  39147  -  306  hypothetical protein  YP_973810  normal  0.143006  normal  0.57808  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4652  CDS  NC_008760  39299  40243  +  945  hypothetical protein  YP_973811  normal  0.0779138  normal  0.4298  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4653  CDS  NC_008760  40447  41526  +  1080  hypothetical protein  YP_973812  normal  0.219524  normal  0.625872  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4654  CDS  NC_008760  41568  42146  +  579  stress protein  YP_973813  normal  0.0674127  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4655  CDS  NC_008760  42183  42758  +  576  stress protein  YP_973814  normal  0.117169  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4656    NC_008760  42913  43213  +  301      normal  0.267939  normal  0.946279  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4657  CDS  NC_008760  43355  43936  +  582  stress protein  YP_973815  normal  0.325263  normal  0.761079  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4658  CDS  NC_008760  43944  44963  +  1020  hypothetical protein  YP_973816  normal  1  normal  0.601408  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4659  CDS  NC_008760  45017  46171  +  1155  hypothetical protein  YP_973817  normal  0.502748  normal  0.783273  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4660  CDS  NC_008760  46149  46904  +  756  hypothetical protein  YP_973818  normal  0.808713  normal  0.527012  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4661  CDS  NC_008760  46901  47992  +  1092  hypothetical protein  YP_973819  normal  1  normal  0.423075  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4662  CDS  NC_008760  47985  48932  +  948  ATP/GTP-binding protein  YP_973820  normal  1  normal  0.40759  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4663  CDS  NC_008760  48977  50191  +  1215  stress protein  YP_973821  normal  1  normal  0.298991  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4664  CDS  NC_008760  50202  51701  -  1500  serine/threonine protein kinase  YP_973822  normal  1  normal  0.109697  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4665  CDS  NC_008760  51798  53528  -  1731  hypothetical protein  YP_973823  normal  0.609083  normal  0.0906137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4666  CDS  NC_008760  53531  54583  -  1053  von Willebrand factor, type A  YP_973824  normal  0.404551  normal  0.0464435  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4667  CDS  NC_008760  54668  55309  -  642  von Willebrand factor, type A  YP_973825  normal  0.40968  normal  0.0500765  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4668  CDS  NC_008760  55316  55957  -  642  stress protein  YP_973826  normal  0.568627  normal  0.0479179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4669  CDS  NC_008760  55970  56608  -  639  von Willebrand factor, type A  YP_973827  normal  0.264174  normal  0.0341202  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4670  CDS  NC_008760  56855  57163  -  309  hypothetical protein  YP_973828  normal  0.279731  normal  0.110126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4671  CDS  NC_008760  57275  57910  -  636  hypothetical protein  YP_973829  normal  0.195271  normal  0.101554  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4672  CDS  NC_008760  57907  58269  -  363  hypothetical protein  YP_973830  normal  0.22674  normal  0.0530626  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4673  CDS  NC_008760  58280  58612  -  333  hypothetical protein  YP_973831  normal  0.202164  normal  0.0555338  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4674  CDS  NC_008760  58612  59625  -  1014  curli production assembly/transport component CsgG  YP_973832  normal  0.501006  normal  0.0721593  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4675  CDS  NC_008760  59744  60235  -  492  hypothetical protein  YP_973833  normal  0.844349  normal  0.04296  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4676  CDS  NC_008760  60390  60749  +  360  hypothetical protein  YP_973834  normal  1  normal  0.0424911  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4677  CDS  NC_008760  60764  61114  -  351  transposase, IS4 family protein  YP_973835  normal  0.692976  normal  0.0315597  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4678    NC_008760  61226  61508  -  283      normal  1  normal  0.0323239  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4679  CDS  NC_008760  61667  61933  +  267  hypothetical protein  YP_973836  normal  0.853772  normal  0.0426243  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4680  CDS  NC_008760  62434  62937  +  504  hypothetical protein  YP_973837  normal  0.512197  normal  0.0283487  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4681  CDS  NC_008760  63330  63785  +  456  hypothetical protein  YP_973838  normal  0.337084  normal  0.0146225  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4682  CDS  NC_008760  63782  64255  +  474  hypothetical protein  YP_973839  normal  0.761254  normal  0.0108337  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4683  CDS  NC_008760  64442  64915  +  474  hypothetical protein  YP_973840  normal  1  decreased coverage  0.00790472  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4684  CDS  NC_008760  64908  65852  +  945  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  YP_973841  normal  1  decreased coverage  0.00715956  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4685  CDS  NC_008760  65962  66531  +  570  hypothetical protein  YP_973842  normal  1  decreased coverage  0.0057537  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4686  CDS  NC_008760  66643  67548  -  906  TniB family protein  YP_973843  normal  0.60041  normal  0.0211663  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4687  CDS  NC_008760  67549  68055  -  507  integrase, catalytic region  YP_973844  normal  0.887528  normal  0.0224693  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4688  CDS  NC_008760  68146  69294  -  1149  integrase catalytic subunit  YP_973845  normal  1  normal  0.03329  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4689  CDS  NC_008760  69633  70439  +  807  hypothetical protein  YP_973846  normal  0.427462  normal  0.0184868  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4690  CDS  NC_008760  70526  70747  -  222  hypothetical protein  YP_973847  normal  0.0906435  normal  0.0131343  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4691  CDS  NC_008760  71222  73051  +  1830  phage integrase family protein  YP_973848  normal  0.298565  normal  0.0454355  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4692  CDS  NC_008760  73475  74488  -  1014  parB-like partition proteins  YP_973849  normal  0.0209451  normal  0.185793  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4693  CDS  NC_008760  74464  75657  -  1194  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_973850  normal  0.0183804  normal  0.0975853  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4694  CDS  NC_008760  76069  77499  +  1431  initiator RepB protein  YP_973851  normal  0.251303  normal  0.0571299  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4695  CDS  NC_008760  77991  78503  -  513  hypothetical protein  YP_973852  normal  0.511609  normal  0.0321504  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4696  CDS  NC_008760  78617  79819  +  1203  beta-lactamase domain-containing protein  YP_973853  normal  0.750931  normal  0.0866563  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4697  CDS  NC_008760  80148  80435  +  288  hypothetical protein  YP_973854  normal  1  normal  0.0705636  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4698  CDS  NC_008760  80432  81538  +  1107  parB-like partition proteins  YP_973855  normal  1  normal  0.107373  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4699    NC_008760  82226  83228  +  1003      normal  1  normal  0.102528  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4700  CDS  NC_008760  83264  84334  +  1071  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_973856  normal  1  normal  0.0467137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4701    NC_008760  84336  84506  +  171      normal  1  normal  0.0699143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4702  CDS  NC_008760  84547  84747  -  201  transposase IS66  YP_973857  normal  1  normal  0.0921024  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4703    NC_008760  84801  85007  +  207      normal  1  normal  0.0921024  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4704  CDS  NC_008760  85262  87331  +  2070  recombinase  YP_973858  normal  0.461368  normal  0.172912  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4705  CDS  NC_008760  87344  88750  -  1407  transposase IS66  YP_973859  normal  0.465239  normal  0.0997646  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4706  CDS  NC_008760  88833  89174  -  342  IS66 Orf2 family protein  YP_973860  normal  0.343016  normal  0.106133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4707  CDS  NC_008760  89171  89563  -  393  transposase IS3/IS911 family protein  YP_973861  normal  0.15139  normal  0.0855064  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4708  CDS  NC_008760  89634  89930  +  297  IS66 Orf2 family protein  YP_973862  normal  0.123105  normal  0.103462  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4709  CDS  NC_008760  90013  91506  +  1494  transposase IS66  YP_973863  normal  0.276755  normal  0.140797  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4710  CDS  NC_008760  91671  92828  +  1158  hypothetical protein  YP_973864  normal  1  normal  0.198903  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4711  CDS  NC_008760  92961  93977  +  1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_973865  normal  1  normal  0.266875  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>