27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4661 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4661  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1270  hypothetical protein  43.1 
 
 
369 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1005  hypothetical protein  44.57 
 
 
374 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0899  hypothetical protein  51.78 
 
 
364 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5099  hypothetical protein  39.33 
 
 
370 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0141  hypothetical protein  38.76 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4763  hypothetical protein  40.39 
 
 
375 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5093  hypothetical protein  38.2 
 
 
370 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0276  hypothetical protein  43.92 
 
 
364 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0581  hypothetical protein  38.08 
 
 
396 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0805  hypothetical protein  42.31 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0937  hypothetical protein  40.72 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33900  hypothetical protein  39.62 
 
 
390 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0342  hypothetical protein  37.06 
 
 
405 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3011  hypothetical protein  39.66 
 
 
393 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000441117  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3793  hypothetical protein  39.95 
 
 
359 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.625203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0658  hypothetical protein  39.95 
 
 
359 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515936  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3881  hypothetical protein  39.95 
 
 
359 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3187  hypothetical protein  41.16 
 
 
384 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3668  hypothetical protein  39.06 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3690  hypothetical protein  39.89 
 
 
360 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1346  hypothetical protein  39.57 
 
 
359 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1064  hypothetical protein  38.59 
 
 
389 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.819996  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0756  hypothetical protein  39.16 
 
 
397 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.608689  normal  0.219757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0084  hypothetical protein  36.53 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0753  hypothetical protein  37.47 
 
 
393 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.176602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3305  hypothetical protein  38.84 
 
 
385 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0294126  normal  0.309203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>