24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4710 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  785    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  61.7 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  61.7 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  61.7 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  61.44 
 
 		 452 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  61.44 
 
 		 452 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  61.18 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  58.03 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  55.7 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  58.46 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3753  hypothetical protein  56.73 
 
 		 105 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0113248  hitchhiker  0.00544666 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8496  hypothetical protein  60 
 
 		 186 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  62.67 
 
 		 205 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  32.7 
 
 		 474 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  32.7 
 
 		 474 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  32.7 
 
 		 474 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  32.7 
 
 		 474 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  32.7 
 
 		 474 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  33.85 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3218  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3752  hypothetical protein  42.73 
 
 		 110 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00106012  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  23.4 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  23.4 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0363  hypothetical protein  32.73 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>