31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6371 on replicon NC_010514
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  875    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  76.44 
 
 
433 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  57.51 
 
 
452 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  57.51 
 
 
452 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  57.51 
 
 
452 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  57.51 
 
 
452 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  57.51 
 
 
452 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  57.04 
 
 
452 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  58.03 
 
 
385 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  55.1 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8496  hypothetical protein  75.56 
 
 
186 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  50 
 
 
205 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  33.25 
 
 
474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  33.25 
 
 
474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  33.25 
 
 
474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  33.25 
 
 
474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  33.42 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  33.42 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3752  hypothetical protein  40.91 
 
 
110 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00106012  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3753  hypothetical protein  54.43 
 
 
105 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0113248  hitchhiker  0.00544666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  23.73 
 
 
458 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  23.73 
 
 
458 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3218  hypothetical protein  48.81 
 
 
172 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  28 
 
 
249 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3420  hypothetical protein  31.97 
 
 
142 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1877  hypothetical protein  38.57 
 
 
80 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4091  transposase IS4 family protein  29.47 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4664  transposase IS4 family protein  29.47 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3298  transposase, IS4  28.44 
 
 
246 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2861  transposase, IS4 family protein  39.47 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1568  transposase, IS4 family protein  39.47 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>