34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4013 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  100 
 
 		 474 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  100 
 
 		 474 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  99.76 
 
 		 428 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  99.79 
 
 		 474 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  100 
 
 		 474 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  100 
 
 		 474 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  71.17 
 
 		 249 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  62.67 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3420  hypothetical protein  74.04 
 
 		 142 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  33.51 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  33.24 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  31.18 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  32.79 
 
 		 312 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3298  transposase, IS4  34.7 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2002  hypothetical protein  92.59 
 
 		 80 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.391718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  23.33 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  23.33 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  28.66 
 
 		 205 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1611  transposase, putative  24.48 
 
 		 336 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.77283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0684  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0758  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.686568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0768  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0939  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1159  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00129993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1521  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.626511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2000  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2274  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4070  hypothetical protein  20.39 
 
 		 311 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>