168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3080 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  899    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  87.35 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  87.06 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  47.09 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  45.93 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  44.06 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  44.06 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  43.77 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  43.77 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  38.51 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  40.06 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  63.33 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  62.67 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  62.67 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  62.67 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  62.67 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  39.88 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  35.96 
 
 		 401 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  35.96 
 
 		 401 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  35.67 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  35.38 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  34.42 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  34.42 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  35.52 
 
 		 356 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  32.34 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  44.24 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  58.82 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  26.9 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  26.9 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  26.46 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  26.46 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  26.46 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  28.94 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  25.56 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  25.28 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  25.28 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  25.28 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  25 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  25 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7114  transposase, IS4 family protein  43.62 
 
 		 100 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0985556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03093  hypothetical protein  25.07 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  24.93 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  23.72 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>