176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2879 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  100 
 
 		 402 aa  813    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  100 
 
 		 402 aa  813    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  49 
 
 		 420 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  49 
 
 		 420 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  49 
 
 		 420 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  49 
 
 		 420 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  47.85 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  46.02 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  44.64 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  37.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  37.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  37.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  37.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  37.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  37.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  46.59 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  37 
 
 		 451 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  36.43 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  36.5 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  38.87 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  36.54 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  35.89 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  35.89 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  35.89 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  32.89 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  32.89 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  29.95 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  32.89 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  32.89 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  30.46 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  30.46 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  30.46 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  34.42 
 
 		 451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  30.2 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  30.2 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  31.41 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  31.41 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  29.25 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  28.91 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  28.91 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  28.38 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  28.91 
 
 		 442 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  28.91 
 
 		 442 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  28.65 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  28.65 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  28.65 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  26.49 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  26.49 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  26.49 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  31.29 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  28.65 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  28.65 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  28.91 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  28.38 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  37.56 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  29.61 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  29.61 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  28.46 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  29.46 
 
 		 542 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32100  Transposase, IS4 protein  29.34 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  27.6 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  27.89 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>