169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3429 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  100 
 
 
421 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  48.44 
 
 
406 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  45.78 
 
 
420 aa  316  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  45.78 
 
 
420 aa  316  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  45.78 
 
 
420 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  45.78 
 
 
420 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  42.37 
 
 
401 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  42.37 
 
 
401 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  42.37 
 
 
401 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  45.66 
 
 
402 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  45.66 
 
 
402 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  44.25 
 
 
382 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  42.07 
 
 
415 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  41.83 
 
 
415 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  39.05 
 
 
412 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  38.61 
 
 
369 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  38.83 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  38.83 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  38.83 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  38.83 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  38.83 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  38.83 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  39.26 
 
 
356 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  44.52 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  40.46 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  37.15 
 
 
451 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  30.13 
 
 
436 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  30.21 
 
 
441 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
441 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  31.28 
 
 
449 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  31.28 
 
 
449 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  31.28 
 
 
449 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  28.1 
 
 
442 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  28.1 
 
 
442 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  27.85 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  28.1 
 
 
442 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  28.1 
 
 
442 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  27.85 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  27.85 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  28.54 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  28.23 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  27.85 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  27.85 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  28.1 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  27.97 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  28.34 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  27.85 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  28.34 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  27.45 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  27.45 
 
 
440 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  27.45 
 
 
440 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  27.45 
 
 
440 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
446 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  27.45 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  27.62 
 
 
442 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  27.62 
 
 
442 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  27.62 
 
 
442 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  27.62 
 
 
442 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  27.17 
 
 
440 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  27.17 
 
 
440 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  29.84 
 
 
378 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  28.18 
 
 
542 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00016  transposase  28.13 
 
 
453 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00934  hypothetical protein  28.13 
 
 
453 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01079  hypothetical protein  28.13 
 
 
440 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01686  hypothetical protein  28.13 
 
 
453 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02565  hypothetical protein  28.13 
 
 
440 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03031  hypothetical protein  28.13 
 
 
453 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05967  hypothetical protein  28.13 
 
 
453 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>