162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3719 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  100 
 
 
356 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  43.4 
 
 
406 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  41.3 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  41.3 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  41.3 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  40.53 
 
 
420 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  40.53 
 
 
420 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  40.53 
 
 
420 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  40.53 
 
 
420 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  38.87 
 
 
402 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  38.87 
 
 
402 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  38.99 
 
 
421 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  39.12 
 
 
382 aa  199  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  43.72 
 
 
318 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  38.1 
 
 
412 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  36.81 
 
 
425 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  36.81 
 
 
425 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  36.81 
 
 
425 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  36.81 
 
 
425 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  36.81 
 
 
425 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  36.81 
 
 
425 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
369 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  35.25 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  34.99 
 
 
415 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  37.03 
 
 
451 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  35.52 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  29.75 
 
 
440 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  29.75 
 
 
440 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 
442 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 
442 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 
442 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 
442 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
441 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  28.08 
 
 
449 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  28.08 
 
 
449 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  28.08 
 
 
449 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  29.04 
 
 
437 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03516  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00016  transposase  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00934  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01079  hypothetical protein  26.98 
 
 
440 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01686  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02565  hypothetical protein  26.98 
 
 
440 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03031  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05441  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05910  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05967  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
446 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  25.07 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  25.07 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  25.07 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  25.66 
 
 
442 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  25.66 
 
 
442 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
446 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  24.21 
 
 
440 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  24.21 
 
 
440 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  24.21 
 
 
440 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  24.14 
 
 
448 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  25.36 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  25.36 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  23.82 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02974  hypothetical protein  26.7 
 
 
435 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05087  hypothetical protein  26.7 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  25.36 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  23.82 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  23.82 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  24.78 
 
 
440 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  24.14 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>