166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2130 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  100 
 
 		 382 aa  777    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  75.29 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  75.29 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  75.29 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  75.29 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  50.29 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  55.33 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  50.29 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  50.29 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  50.29 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  50.29 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  50.29 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  49.86 
 
 		 406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  45.93 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  46.26 
 
 		 415 aa  262  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  44.19 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  44.19 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  44.19 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  45.98 
 
 		 415 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  44.64 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  44.64 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  43.97 
 
 		 421 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  41.81 
 
 		 369 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  36.52 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  37.08 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  39.12 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  44.3 
 
 		 284 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7114  transposase, IS4 family protein  63.16 
 
 		 100 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0985556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 446 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  25.44 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  25.44 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  25.44 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  25.15 
 
 		 440 aa  89.7  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  26.73 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  26.73 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  26.73 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  26.73 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  26.93 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  26.93 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  26.93 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07051  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03259  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  26.71 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  26.42 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  26.42 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00783  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00994  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02492  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02898  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04997  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05310  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05790  hypothetical protein  25.66 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06275  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06393  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06951  hypothetical protein  26.13 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  26.42 
 
 		 542 aa  86.7  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  26.1 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  26.1 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  26.42 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  25.36 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  25.36 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  25.36 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  25.36 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>