163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4822 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  100 
 
 
425 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  100 
 
 
425 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  100 
 
 
425 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  100 
 
 
425 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  100 
 
 
425 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  100 
 
 
425 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
420 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
420 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
420 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
420 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  48.28 
 
 
415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  48.04 
 
 
415 aa  354  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  50.29 
 
 
382 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  47.09 
 
 
451 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  65.91 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  41.42 
 
 
406 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  39.56 
 
 
401 aa  256  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  39.56 
 
 
401 aa  256  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  39.56 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  37.56 
 
 
402 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  37.56 
 
 
402 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  43.69 
 
 
318 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
421 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  36.73 
 
 
356 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 
369 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  34.61 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  32.75 
 
 
451 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  29.78 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  29.78 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  29.78 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  27.08 
 
 
440 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  27.08 
 
 
440 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
446 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
378 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  26.95 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  26.95 
 
 
435 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  26.95 
 
 
435 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  27.11 
 
 
440 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  27.11 
 
 
440 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  27.11 
 
 
440 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 
440 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  26.84 
 
 
440 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  27.85 
 
 
441 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
442 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
442 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
442 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
442 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
441 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 
440 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  24.63 
 
 
456 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03093  hypothetical protein  25.47 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  26.12 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  26.12 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  26.12 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  26.12 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  26.12 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>