168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0424 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  65.91 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  65.91 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  65.91 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  65.91 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  65.91 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  65.91 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  52.71 
 
 
415 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  52.71 
 
 
415 aa  205  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  48.42 
 
 
420 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  48.42 
 
 
420 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  47.96 
 
 
420 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  47.96 
 
 
420 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
401 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
401 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
401 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  40.78 
 
 
406 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  44.3 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  37.56 
 
 
402 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  37.56 
 
 
402 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  44.24 
 
 
451 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  32.7 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  33.18 
 
 
369 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2960  RNA-directed DNA polymerase  68.25 
 
 
593 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4361  RNA-directed DNA polymerase  68.25 
 
 
593 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4607  RNA-directed DNA polymerase  68.25 
 
 
593 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  34.86 
 
 
412 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  32.67 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  34.35 
 
 
440 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  34.35 
 
 
440 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  45.33 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  34.78 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  34.31 
 
 
449 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  34.31 
 
 
449 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  34.31 
 
 
449 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1921  RNA-directed DNA polymerase  58.93 
 
 
595 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  34.09 
 
 
442 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  34.09 
 
 
442 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  34.09 
 
 
442 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  34.09 
 
 
442 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
441 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  27.5 
 
 
440 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  27.5 
 
 
440 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  27.5 
 
 
440 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  27.5 
 
 
440 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
446 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
378 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
446 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04870  hypothetical protein  28.48 
 
 
386 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2443  transposase, degenerate  39.51 
 
 
104 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.296726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00016  transposase  28.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00934  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03031  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03516  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05087  hypothetical protein  28.48 
 
 
440 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05441  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05910  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05967  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01079  hypothetical protein  28.48 
 
 
440 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01905  hypothetical protein  28.48 
 
 
232 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02565  hypothetical protein  28.48 
 
 
440 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01686  hypothetical protein  28.48 
 
 
453 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02974  hypothetical protein  28.48 
 
 
435 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  28.31 
 
 
440 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  28.7 
 
 
456 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>