180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4135 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  99.55 
 
 		 440 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  99.55 
 
 		 440 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  99.55 
 
 		 440 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  100 
 
 		 440 aa  911    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  97.27 
 
 		 440 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  96.82 
 
 		 446 aa  887    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  96 
 
 		 378 aa  750    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  96.59 
 
 		 440 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  96.82 
 
 		 440 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  96.36 
 
 		 440 aa  880    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  96.82 
 
 		 440 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  96.82 
 
 		 440 aa  884    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  96.82 
 
 		 446 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  97.27 
 
 		 440 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  97.05 
 
 		 440 aa  884    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  97.27 
 
 		 440 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  97.05 
 
 		 440 aa  885    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  97.27 
 
 		 440 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  97.27 
 
 		 440 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  53.88 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  52.74 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  52.74 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  52.74 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  52.74 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  52.74 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  52.74 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  52.74 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  52.27 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  52.27 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  52.51 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  52.27 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  52.27 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  52.27 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  52.03 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  52.03 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  52.03 
 
 		 448 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  55.52 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  55.37 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  47.95 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  47.95 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  47.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  47.95 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  54.18 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  49.17 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  56.69 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  49.77 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05740  hypothetical protein  49.35 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03093  hypothetical protein  51.54 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  38.73 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  38.5 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  40.48 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  40.48 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  40.48 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  38.44 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  38.44 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00934  hypothetical protein  36.09 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01079  hypothetical protein  36.09 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02565  hypothetical protein  36.09 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03031  hypothetical protein  36.09 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>