179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1743 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  100 
 
 
406 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  51.1 
 
 
401 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  51.1 
 
 
401 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  51.1 
 
 
401 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  50.24 
 
 
420 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  50.24 
 
 
420 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  50.24 
 
 
420 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  50.24 
 
 
420 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  48.67 
 
 
421 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  46.27 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  46.27 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  50.43 
 
 
382 aa  311  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  42.58 
 
 
415 aa  282  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  42.82 
 
 
415 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  41.91 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  41.91 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  41.91 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  41.91 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  41.91 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  41.91 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  43.38 
 
 
369 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  43.94 
 
 
356 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  48.46 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  39.66 
 
 
412 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  40.83 
 
 
451 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  39.66 
 
 
451 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  33.07 
 
 
449 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  33.07 
 
 
449 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  33.07 
 
 
449 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  30.18 
 
 
440 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  30.18 
 
 
440 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  30.13 
 
 
442 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  30.13 
 
 
442 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  30.13 
 
 
442 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  30.13 
 
 
442 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  30.05 
 
 
436 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  29.09 
 
 
442 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  29.09 
 
 
442 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  29.09 
 
 
442 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  29.09 
 
 
442 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  28.83 
 
 
442 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  28.83 
 
 
442 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
442 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  28.83 
 
 
442 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  29.09 
 
 
448 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  28.83 
 
 
448 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  28.83 
 
 
448 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  28.83 
 
 
448 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  28.83 
 
 
448 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  28.94 
 
 
448 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  136  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  29.78 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  28.83 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  29.78 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  29.64 
 
 
542 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  29.07 
 
 
400 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  40.18 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  29.4 
 
 
441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
441 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1661  IS4 family transposase  30.96 
 
 
458 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  27.96 
 
 
437 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2539  IS4 family transposase  30.68 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542819  hitchhiker  0.00975932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  26.7 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 
440 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  26.17 
 
 
456 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  26.68 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>