202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2280 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  99.32 
 
 
442 aa  907    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  99.55 
 
 
442 aa  910    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  99.55 
 
 
442 aa  910    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  99.1 
 
 
442 aa  906    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  98.87 
 
 
442 aa  903    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  99.1 
 
 
442 aa  906    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  99.32 
 
 
442 aa  907    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  99.78 
 
 
448 aa  927    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  99.11 
 
 
448 aa  919    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  99.73 
 
 
542 aa  765    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  99.48 
 
 
395 aa  804    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  99.55 
 
 
448 aa  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  99.78 
 
 
448 aa  927    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  99.24 
 
 
400 aa  820    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  91.94 
 
 
436 aa  833    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  99.1 
 
 
442 aa  906    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  99.78 
 
 
448 aa  927    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  99.55 
 
 
448 aa  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  100 
 
 
448 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  99.55 
 
 
448 aa  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  99.74 
 
 
395 aa  805    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  99.33 
 
 
448 aa  920    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  99.55 
 
 
448 aa  921    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  52.13 
 
 
446 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  52.13 
 
 
446 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  53.22 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  52.74 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  52.74 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  52.74 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  52.74 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  52.98 
 
 
440 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  52.51 
 
 
440 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  52.74 
 
 
440 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  52.74 
 
 
440 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  52.74 
 
 
440 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  51.61 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  50.34 
 
 
456 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  51.5 
 
 
440 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  48.17 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  47.92 
 
 
435 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  53.24 
 
 
378 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  47.92 
 
 
435 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05740  hypothetical protein  52.14 
 
 
383 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03093  hypothetical protein  53.48 
 
 
357 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  38.34 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  38.34 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  38.34 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  38.06 
 
 
440 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  38.06 
 
 
440 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  36.12 
 
 
437 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>