199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1038 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  92.17 
 
 		 442 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  92.17 
 
 		 442 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  91.47 
 
 		 442 aa  832    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  91.71 
 
 		 442 aa  833    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  91.71 
 
 		 442 aa  833    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  91.94 
 
 		 442 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  91.94 
 
 		 442 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  91.71 
 
 		 448 aa  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  92.33 
 
 		 400 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  91.01 
 
 		 448 aa  824    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  91.71 
 
 		 448 aa  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  92.52 
 
 		 542 aa  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  91.71 
 
 		 448 aa  832    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  835    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  91.47 
 
 		 448 aa  829    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  92.41 
 
 		 395 aa  744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 436 aa  897    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  91.71 
 
 		 442 aa  833    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  91.71 
 
 		 448 aa  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  91.47 
 
 		 448 aa  828    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  92.65 
 
 		 395 aa  744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  91.94 
 
 		 448 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  91.47 
 
 		 448 aa  827    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  53.88 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  54.13 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  54.13 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  54.13 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  53.88 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  53.88 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  53.88 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  53.4 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  53.64 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  53.4 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  53.4 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  53.4 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  50.8 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  51.45 
 
 		 456 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  52.29 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  48.85 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  48.85 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  48.85 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  54.27 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05740  hypothetical protein  51.47 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03093  hypothetical protein  53.2 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  39.95 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  39.95 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  39.95 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  37.74 
 
 		 440 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  37.74 
 
 		 440 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  37.18 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  35.41 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  35.41 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  35.41 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>