175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5533 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  100 
 
 
420 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  100 
 
 
420 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
420 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
420 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  75.29 
 
 
382 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  50 
 
 
406 aa  362  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 
401 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 
401 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 
401 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
425 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
425 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
425 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
425 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
425 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  48.64 
 
 
425 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  49 
 
 
402 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  49 
 
 
402 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  46.38 
 
 
415 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  55.85 
 
 
318 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  46.14 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  45.52 
 
 
421 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  42.93 
 
 
369 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  39.8 
 
 
412 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  43.77 
 
 
451 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  40.53 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  39.14 
 
 
451 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0424  hypothetical protein  47.96 
 
 
284 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  29.23 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  29.23 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  28.97 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  28.97 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  29.23 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  29.23 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  28.97 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  30.28 
 
 
436 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  28.72 
 
 
448 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  28.97 
 
 
448 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  29.29 
 
 
542 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  29.5 
 
 
435 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  29.5 
 
 
435 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  29.5 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  28.72 
 
 
442 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  29.65 
 
 
395 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  29.65 
 
 
395 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  28.93 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  28.93 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  28.93 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  28.72 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  28.8 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  28.68 
 
 
440 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  28.68 
 
 
446 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  28.43 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  30.23 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  28.83 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  29.21 
 
 
441 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  29.21 
 
 
441 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  29.21 
 
 
441 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  29.21 
 
 
441 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  29.21 
 
 
441 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>