181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0196 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 369 aa  758    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2879  IS4 family transposase  47.85 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.487698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4154  transposase ISRme8  47.85 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  42.93 
 
 		 420 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  42.93 
 
 		 420 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  42.93 
 
 		 420 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  42.93 
 
 		 420 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  44.15 
 
 		 406 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  41.24 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  41.24 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  41.24 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  38.92 
 
 		 421 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2130  transposase, IS4  41.81 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  35.92 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6334  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1889  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3082  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3748  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4822  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5536  transposase IS4 family protein  33.06 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3719  transposase, IS4 family  36.73 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255978  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2145  insertion element hypothetical protein  39.34 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4214  insertion element hypothetical protein  33.15 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  35.69 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0296  insertion element hypothetical protein  32.88 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3080  hypothetical protein  32.34 
 
 		 451 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2443  transposase, degenerate  86.75 
 
 		 104 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.296726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  29.49 
 
 		 448 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  29.21 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  29.21 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  29.64 
 
 		 448 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  29.05 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  28.77 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  29.05 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  29.05 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  28.77 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  29.21 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  29.21 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  29.21 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  29.21 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  29.21 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  28.49 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  28.93 
 
 		 448 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  29.58 
 
 		 440 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  29.58 
 
 		 440 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  28.69 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  28.98 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  28.65 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  28.81 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5733  transposase IS4 family protein  27.75 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7275  transposase IS4 family protein  27.75 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7667  transposase IS4 family protein  27.75 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.738025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7817  transposase IS4 family protein  27.75 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  28.41 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  26.89 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  26.89 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  26.89 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  26.59 
 
 		 446 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  26.59 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  28.96 
 
 		 542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  26.77 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  27.97 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 		 440 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 		 440 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>