153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4668 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4668  stress protein  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.568627  normal  0.0479179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0507  tellurium resistance protein  67.45 
 
 
213 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1087  tellurium resistance protein  67.45 
 
 
213 aa  295  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0569  stress protein  67.45 
 
 
213 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3686  stress protein  67.14 
 
 
214 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1165  stress protein  53.85 
 
 
222 aa  230  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5053  stress protein  43.35 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384692  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  41.41 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  41.41 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  41.41 
 
 
192 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  41.41 
 
 
192 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  41.41 
 
 
192 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  38.89 
 
 
192 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  40.4 
 
 
192 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  38.89 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  40.91 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  39.9 
 
 
191 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  39.9 
 
 
190 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  40.91 
 
 
191 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  40.2 
 
 
192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  40.4 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  39.9 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  39.9 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0824  stress protein  39.25 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  39.9 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  40.91 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  39.9 
 
 
192 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  39.9 
 
 
191 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  40.4 
 
 
191 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  40.91 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  39.9 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  41 
 
 
192 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  38.89 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  40.4 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  38.69 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  37.37 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  37.37 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  38.89 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  39.2 
 
 
192 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  40 
 
 
192 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  39.39 
 
 
192 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  38.38 
 
 
194 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  38.69 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3019  stress protein  40.1 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000174697  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  38.38 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  38.12 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  37.88 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  38.19 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  38.07 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
194 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  37.88 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  38.19 
 
 
192 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  37.69 
 
 
192 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  37.69 
 
 
192 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  37.69 
 
 
192 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  37.69 
 
 
192 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
194 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
194 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
194 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
196 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  37.88 
 
 
196 aa  124  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  37.88 
 
 
196 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
191 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  38.12 
 
 
194 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  38.38 
 
 
191 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  37.19 
 
 
191 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  36.36 
 
 
218 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  37 
 
 
192 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  36.87 
 
 
192 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  37.88 
 
 
191 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  37.88 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33940  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  34.6 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307138  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  36.32 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0635  stress response protein  40.4 
 
 
193 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  35.35 
 
 
192 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  35.82 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  35.32 
 
 
192 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  35.32 
 
 
192 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  32.86 
 
 
198 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  34.27 
 
 
198 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  36.32 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  33.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  32.49 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  37.37 
 
 
191 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  33.18 
 
 
198 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  32.71 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  36.36 
 
 
248 aa  115  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  33.33 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  37.37 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  35.86 
 
 
192 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  38.38 
 
 
191 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  33.67 
 
 
191 aa  111  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>