190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3784 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3872  stress protein  98.95 
 
 
191 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  98.95 
 
 
191 aa  387  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  100 
 
 
191 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  86.91 
 
 
191 aa  343  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  85.34 
 
 
191 aa  336  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  71.2 
 
 
192 aa  285  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  70.16 
 
 
192 aa  279  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  69.63 
 
 
192 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  67.89 
 
 
192 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  67.89 
 
 
192 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  67.89 
 
 
192 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  65.97 
 
 
192 aa  274  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  69.11 
 
 
192 aa  273  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  64.55 
 
 
192 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  65.79 
 
 
191 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  65.79 
 
 
192 aa  267  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  68.59 
 
 
191 aa  266  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  64.92 
 
 
192 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  64.92 
 
 
191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  63.87 
 
 
192 aa  265  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  66.49 
 
 
191 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  67.02 
 
 
222 aa  263  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  63.35 
 
 
191 aa  262  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  65.97 
 
 
191 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  63.87 
 
 
192 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  63.35 
 
 
191 aa  257  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  63.35 
 
 
191 aa  257  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  61.78 
 
 
192 aa  256  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  61.26 
 
 
192 aa  255  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  62.63 
 
 
191 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  64.21 
 
 
191 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  62.83 
 
 
191 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  62.3 
 
 
248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  62.3 
 
 
191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  62.3 
 
 
191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  68.59 
 
 
191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  61.26 
 
 
191 aa  250  8.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  61.26 
 
 
191 aa  249  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  61.78 
 
 
192 aa  248  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  60.21 
 
 
191 aa  247  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  61.38 
 
 
191 aa  247  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  58.95 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  58.64 
 
 
191 aa  241  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  59.47 
 
 
192 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  58.95 
 
 
192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  58.95 
 
 
192 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  237  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  236  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  236  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  60.21 
 
 
191 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  57.89 
 
 
192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  59.47 
 
 
205 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  58.42 
 
 
193 aa  223  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  58.16 
 
 
194 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  56.02 
 
 
194 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  54.97 
 
 
196 aa  221  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  54.97 
 
 
196 aa  221  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  54.97 
 
 
196 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  54.97 
 
 
194 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  54.97 
 
 
194 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  54.97 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  56.84 
 
 
190 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  55.5 
 
 
194 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  54.45 
 
 
194 aa  220  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  54.45 
 
 
194 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  54.45 
 
 
194 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  55.5 
 
 
191 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  53.19 
 
 
190 aa  217  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  52.66 
 
 
189 aa  217  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  56.08 
 
 
191 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  56.12 
 
 
194 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  56.25 
 
 
194 aa  213  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  56.25 
 
 
194 aa  213  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  52.6 
 
 
192 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  52.08 
 
 
192 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  50.26 
 
 
191 aa  206  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  52.38 
 
 
192 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  50 
 
 
192 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  50 
 
 
192 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  50 
 
 
192 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  46.46 
 
 
200 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  48.17 
 
 
186 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  43.98 
 
 
218 aa  184  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  45.54 
 
 
200 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  47.87 
 
 
184 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  46.81 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5504  stress protein  44.24 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390386  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  41.92 
 
 
198 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  41.92 
 
 
198 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  42.47 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  42.47 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  160  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1164  stress protein  41.27 
 
 
191 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>