77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4630 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4630  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
326 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4468  transposase IS4 family protein  49.68 
 
 
321 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5446  transposase IS701 family protein  45.58 
 
 
306 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2138  transposase, IS4  35.74 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.390955  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2313  transposase, IS4  35.74 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3123  transposase, IS4  35.74 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  unclonable  0.0000172155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0478  transposase, IS4  35.42 
 
 
328 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.616853  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1465  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0124  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1496  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.279239  hitchhiker  0.000413072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1498  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29415  hitchhiker  0.000395653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1692  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1934  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2087  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2160  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.639372  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2363  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000393238  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2651  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2667  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0007  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000467317  normal  0.127483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0020  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3235  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0294411  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0398  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0797  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0838  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0906  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444725  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0960  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1174  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1227  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00131975  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1347  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2915  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000386305  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2708  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  0.80509 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3265  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3289  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3354  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3358  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730892  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3401  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0858405  normal  0.124182 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3413  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0628007  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3485  hypothetical protein  38.97 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0240  transposase, IS4  35.51 
 
 
328 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.192612  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1388  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 
343 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1522  transposase, IS4  35.24 
 
 
328 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1854  hypothetical protein  46.58 
 
 
191 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00930083  normal  0.0408168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2528  hypothetical protein  39.6 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0686848  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6808  transposase IS4 family protein  32.05 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3243  hypothetical protein  31.25 
 
 
286 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3859  transposase IS4 family protein  25.38 
 
 
358 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3403  transposase, IS4 family protein  24.84 
 
 
352 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.465217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1136  transposase, IS4 family protein  22.33 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4408  transposase, IS4 family protein  22.33 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0492743  normal  0.342026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1855  hypothetical protein  35.2 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00672548  normal  0.0405478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2868  hypothetical protein  23.67 
 
 
243 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0407  hypothetical protein  24.35 
 
 
231 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2937  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0079  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000349204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0225  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.006695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0252  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.566728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0331  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0408  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0432  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.931638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0817  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.209477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1498  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000398199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2180  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000421211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2707  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000168624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0328  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1163  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1394  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2152  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2690  transposase IS4 family protein  27.94 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3596  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0202  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2824  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1561  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1684  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2377  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1926  transposase IS4 family protein  25.19 
 
 
395 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1670  transposase IS4 family protein  25.19 
 
 
374 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>