More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4650 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4650  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204613  normal  0.663628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  80.68 
 
 
88 aa  146  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3628  transposase IS3/IS911 family protein  76.14 
 
 
88 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00241648  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  72.84 
 
 
87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2146  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1074  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2048  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0705823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0182  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.237707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0122  hypothetical protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0160  transposase  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1552  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4720  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1450  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.23699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2697  transposase  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2224  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0643  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.909976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3352  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0027  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2134  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.692115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2798  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0089  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0511092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3030  transposase  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0022  transposase  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1567  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.996412  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1596  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1425  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.565113  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4647  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1913  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0922  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0437514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3021  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0297  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000529534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0313  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00217618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0782  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1720  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0359558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1167  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1750  transposase subfamily protein  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.834954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1648  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  76.25 
 
 
87 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  76.25 
 
 
87 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  76.25 
 
 
87 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  76.25 
 
 
87 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  76.25 
 
 
87 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0004  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.30755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0111  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000238346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0285  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0322  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.796566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0484  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0496  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0501  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0574  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0758  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0805  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0858  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0898  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1040  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0305091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1078  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1082  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1118  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1204  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1217  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1231  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1256  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2198  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.677304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2250  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2269  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2284  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.884453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2596  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2688  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2760  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2792  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2898  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3007  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3025  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3092  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3393  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.452656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0106  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0275  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0414  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0437  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0498  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0583  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0648  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0725  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1504  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1513  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018385  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1645  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1759  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1788  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1946  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2074  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2424  transposase IS3/IS911  71.43 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0308249  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0166  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0007  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0197592  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0124  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00485388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0194  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.455443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0290  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0146217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0365  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0615521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0378  IS407A, transposase OrfA  75 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>