25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4633 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4633  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  206  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5546  hypothetical protein  90 
 
 
100 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0362  hypothetical protein  73 
 
 
100 aa  154  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1537  hypothetical protein  65.66 
 
 
98 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4205  hypothetical protein  62 
 
 
98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1648  hypothetical protein  62 
 
 
98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02844  hypothetical protein  58.59 
 
 
98 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02894  predicted cyanide hydratase  58.59 
 
 
98 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.401444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3200  hypothetical protein  58.59 
 
 
98 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0678  conserved hypothetical protein  58.59 
 
 
98 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0675  hypothetical protein  58.59 
 
 
98 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3777  hypothetical protein  55 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3529  hypothetical protein  52 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0888  hypothetical protein  56.44 
 
 
100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2209  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.803919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1841  hypothetical protein  46.59 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1336  hypothetical protein  41.58 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4147  hypothetical protein  37.25 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0784504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4194  hypothetical protein  68.52 
 
 
64 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3374  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1299  hypothetical protein  38 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.15173  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4658  hypothetical protein  41.18 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1987  hypothetical protein  36.27 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.740428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1442  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4195  hypothetical protein  72.73 
 
 
33 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284101  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1411  hypothetical protein  30.21 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>