22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4660 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  38.89 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  38.71 
 
 		 270 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  38.71 
 
 		 270 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  38.71 
 
 		 270 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  36.99 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  33.47 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  34.4 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  34.39 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  33.73 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  33.09 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  30.98 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  30.36 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  28.5 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  26.64 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  23.62 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  29.96 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  26.79 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  21.72 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  22.17 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>