148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4663 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  100 
 
 
404 aa  825    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  39.85 
 
 
402 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  40.61 
 
 
389 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  42.97 
 
 
401 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  37.24 
 
 
394 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  37.24 
 
 
394 aa  256  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  37.24 
 
 
394 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  38.57 
 
 
418 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  36.63 
 
 
419 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  37.75 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  36.32 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  35.44 
 
 
427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  37.5 
 
 
385 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  34.69 
 
 
384 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  44.14 
 
 
226 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  42.06 
 
 
225 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  44.64 
 
 
244 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  43.12 
 
 
233 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  32.73 
 
 
370 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  33.92 
 
 
401 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  41.62 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  40.62 
 
 
245 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  43.71 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  44.44 
 
 
532 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  37.55 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  36.68 
 
 
233 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  39.67 
 
 
232 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  33.18 
 
 
431 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  25.65 
 
 
402 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  25.65 
 
 
401 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  25.45 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  36.17 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  32.85 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  31.79 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  31.13 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  31.13 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  33.53 
 
 
675 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  31.79 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  30.72 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  31.13 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  30.72 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  31.13 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  31.13 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  31.39 
 
 
611 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  31.13 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  31.33 
 
 
192 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  32.24 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  33.33 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  31.54 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  32 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  32 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  32 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  32 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  32 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  32 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  30.26 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  36.09 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  30.87 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  30.87 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  32 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  32 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.86 
 
 
590 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  30.92 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  28.66 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  30.5 
 
 
560 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  32 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  32.24 
 
 
191 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  29.22 
 
 
186 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  24.46 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  31.41 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  32.21 
 
 
722 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  31.13 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  31.94 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  30.08 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  28.48 
 
 
689 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  32.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  27.56 
 
 
191 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  28 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  32.24 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  27.27 
 
 
190 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  27.46 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  27.92 
 
 
191 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  28.48 
 
 
192 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  30.94 
 
 
479 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  27.33 
 
 
191 aa  63.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  25.64 
 
 
192 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  25.64 
 
 
192 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  26.11 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  31.85 
 
 
191 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  31.43 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  27.4 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  25.17 
 
 
192 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  28.37 
 
 
545 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  27.22 
 
 
248 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  32.47 
 
 
191 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  25.17 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  27.15 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  28.39 
 
 
191 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  28.21 
 
 
191 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37550  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  27.13 
 
 
190 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>