148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3876 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  100 
 
 		 394 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  100 
 
 		 394 aa  811    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  100 
 
 		 394 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  68.53 
 
 		 385 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  63.45 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  52.68 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  49.05 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  48.46 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  47.22 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  47.12 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  47.64 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  42.07 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  39.9 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  38.7 
 
 		 418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  37.24 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  36.58 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  43.78 
 
 		 225 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  45.45 
 
 		 226 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  43.27 
 
 		 244 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  43.81 
 
 		 233 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  43.42 
 
 		 245 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  43.79 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  28.42 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  27.6 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  27.6 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  36.36 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  32.21 
 
 		 233 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  37.5 
 
 		 191 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  34.38 
 
 		 427 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  33.16 
 
 		 192 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  37.34 
 
 		 191 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  37.58 
 
 		 191 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  31.34 
 
 		 431 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  38.26 
 
 		 191 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  39.07 
 
 		 191 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  38.56 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  34.9 
 
 		 192 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  34.9 
 
 		 192 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  34.9 
 
 		 192 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  32.09 
 
 		 192 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  39.58 
 
 		 689 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  36.24 
 
 		 191 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  35.29 
 
 		 479 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  33.86 
 
 		 191 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  33.86 
 
 		 191 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  35.67 
 
 		 493 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  32.89 
 
 		 192 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  33.89 
 
 		 289 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  34.71 
 
 		 437 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  29.35 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  31.75 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  31.22 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  35.98 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  31.74 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.04 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  30.69 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  31.87 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  32.5 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  28.88 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  30.12 
 
 		 545 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  30.16 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  34.16 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  26.13 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 196 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 196 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  31.25 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 196 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  33.55 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  33.55 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  30.16 
 
 		 191 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  30.16 
 
 		 191 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  31.75 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  28.04 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  33.77 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  31.54 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  32.96 
 
 		 722 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  31.55 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  32.45 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  32.18 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  32.24 
 
 		 194 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  30.64 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  31.54 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  31.74 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  32.92 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  33.77 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  31.68 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  32.89 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  31.69 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  32.76 
 
 		 192 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  30.46 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  28.57 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  32.18 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  30.13 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  31.79 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  31.61 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>