202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2904 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  910    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  81.11 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  32.05 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  38.14 
 
 		 236 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  39.8 
 
 		 304 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  39.8 
 
 		 301 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  45.56 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  42 
 
 		 220 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  39.29 
 
 		 273 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  39.29 
 
 		 273 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  39.29 
 
 		 273 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  38.81 
 
 		 222 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  39.63 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  38.35 
 
 		 223 aa  133  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  37.14 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  38.31 
 
 		 222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  36.15 
 
 		 243 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  37.38 
 
 		 239 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  35.81 
 
 		 232 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  38.14 
 
 		 219 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  38.14 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  36.36 
 
 		 256 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  34.29 
 
 		 225 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  35.98 
 
 		 225 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  43.48 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  35.98 
 
 		 225 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  37.13 
 
 		 221 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  34.85 
 
 		 230 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  35.18 
 
 		 229 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  31.22 
 
 		 231 aa  106  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  31.25 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  34.25 
 
 		 218 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  29.39 
 
 		 251 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  31.96 
 
 		 194 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  30.93 
 
 		 196 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  31.88 
 
 		 218 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  29.53 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  33.16 
 
 		 192 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  30.93 
 
 		 194 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  30.93 
 
 		 194 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  33.16 
 
 		 192 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  30.41 
 
 		 196 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  30.41 
 
 		 196 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  30.41 
 
 		 194 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  30.41 
 
 		 194 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  30.41 
 
 		 194 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  30.93 
 
 		 194 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  31.02 
 
 		 192 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  33.16 
 
 		 192 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  31.02 
 
 		 192 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  32.63 
 
 		 192 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  32.63 
 
 		 192 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  29.38 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  32.63 
 
 		 192 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  28.88 
 
 		 192 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  28.88 
 
 		 192 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  32.11 
 
 		 192 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  31.18 
 
 		 192 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  34.1 
 
 		 191 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  31.58 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  32.11 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.99 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  34 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  28.72 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  33.33 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  28.64 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  31.96 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  31.77 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  28.57 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  31.92 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  34.95 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  31.12 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  31.12 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  30.41 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  30.39 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  33.33 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  32.47 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  28.3 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  29.63 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  30.13 
 
 		 191 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  27.42 
 
 		 192 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  30.07 
 
 		 191 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  29.63 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  27.98 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  34.44 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  33.55 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  30.41 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  29.61 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  28.65 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  36.46 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  30.07 
 
 		 191 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  30 
 
 		 192 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  30.67 
 
 		 191 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  30.67 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  29.1 
 
 		 192 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  28.12 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  29.1 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  33.33 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  33.74 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>